Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VNN3Q9NY84 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VNN3Q9NY84 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms