Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUA8

ZBTB40, Zinc finger and BTB domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB40Q9NUA8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZBTB40Q9NUA8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZBTB40Q9NUA8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms