Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ECHDC1Q9NTX5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms