Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CTNNBIP1Q9NSA3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms