Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HELLSQ9NRZ9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms