Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSU72Q9NP77 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSU72Q9NP77 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms