Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVK-5Q9HDB9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVK-5Q9HDB9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms