Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TNRC6CQ9HCJ0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms