Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC52A2Q9HAB3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms