Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
C11orf49Q9H6J7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms