Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 AC068733.1-201ENST00000532430 1288 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 LINC00564-201ENST00000567258 1119 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 AC133528.1-201ENST00000608316 805 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SENP3Q9H4L4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 UBE2D3-202ENST00000338145 896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 ARL1-203ENST00000539055 1231 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 MFAP3L-202ENST00000393702 1505 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 TCEAL1-201ENST00000372624 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 TCEAL1-202ENST00000372625 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 MEG8-208ENST00000553465 1176 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SENP3Q9H4L4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms