Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASXL3Q9C0F0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASXL3Q9C0F0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ASXL3Q9C0F0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASXL3Q9C0F0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASXL3Q9C0F0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASXL3Q9C0F0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASXL3Q9C0F0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASXL3Q9C0F0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASXL3Q9C0F0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASXL3Q9C0F0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASXL3Q9C0F0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASXL3Q9C0F0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ASXL3Q9C0F0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASXL3Q9C0F0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASXL3Q9C0F0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASXL3Q9C0F0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASXL3Q9C0F0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASXL3Q9C0F0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASXL3Q9C0F0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASXL3Q9C0F0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASXL3Q9C0F0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ASXL3Q9C0F0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms