Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MAP1LC3CQ9BXW4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms