Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SALL3Q9BXA9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SALL3Q9BXA9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms