Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BRIP1Q9BX63 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRIP1Q9BX63 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms