Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUH8

BEGAIN, Brain-enriched guanylate kinase-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEGAINQ9BUH8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BEGAINQ9BUH8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms