Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEC22CQ9BRL7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEC22CQ9BRL7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms