Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
FYCO1Q9BQS8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FYCO1Q9BQS8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms