Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGIP1Q9BQI5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms