Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PFDN5Q99471 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PFDN5Q99471 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms