Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms