Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMTK3Q96Q04 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms