Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85AQ96PX6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms