Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX27Q96L92 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms