Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCHS1Q96JQ0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCHS1Q96JQ0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms