Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC34Q96HJ3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms