Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCARF2Q96GP6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARF2Q96GP6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms