Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC10A4Q96EP9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC10A4Q96EP9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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