Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SIRT1Q96EB6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SIRT1Q96EB6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms