Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMEM54Q969K7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM54Q969K7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms