Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF3AQ92664 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms