Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms