Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GIPC3Q8TF64 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms