Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IGSF1Q8N6C5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGSF1Q8N6C5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms