Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC24Q8N4L8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC24Q8N4L8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms