Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPC2Q8N158 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPC2Q8N158 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms