Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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RAB11FIP4Q86YS3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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RAB11FIP4Q86YS3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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RAB11FIP4Q86YS3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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RAB11FIP4Q86YS3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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RAB11FIP4Q86YS3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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RAB11FIP4Q86YS3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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RAB11FIP4Q86YS3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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RAB11FIP4Q86YS3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB11FIP4Q86YS3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB11FIP4Q86YS3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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