Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NLRP13Q86W25 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP13Q86W25 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP13Q86W25 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP13Q86W25 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP13Q86W25 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP13Q86W25 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP13Q86W25 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP13Q86W25 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP13Q86W25 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP13Q86W25 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP13Q86W25 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP13Q86W25 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP13Q86W25 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP13Q86W25 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NLRP13Q86W25 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP13Q86W25 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP13Q86W25 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP13Q86W25 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP13Q86W25 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP13Q86W25 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP13Q86W25 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP13Q86W25 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NLRP13Q86W25 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms