Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKD1L3Q7Z443 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms