Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG9AQ7Z3C6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG9AQ7Z3C6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms