Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
STRCQ7RTU9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms