Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP43Q70EL4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP43Q70EL4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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