Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEM1Q6ZVN7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms