Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBR3Q6ZT12 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBR3Q6ZT12 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms