Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00299Q6ZSB3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00299Q6ZSB3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms