Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRIG3Q6UXM1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms