Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LMOD2Q6P5Q4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMOD2Q6P5Q4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms