Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CARMIL2Q6F5E8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CARMIL2Q6F5E8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms