Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGNBP1Q5YKI7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms