Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF123Q5XPI4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms